El 15 de febrero de 1535 Juan de Ampudia y Pedro de Añasco, ingresaron en rápida correría al territorio. A finales de 1542 Pedro de Molina, Alonso del Valle y Hernando de Cepeda, provenientes de Pasto realizaron la segunda entrada, en el mismo año por Hernán Perez de Quesada en un descabellado viaje en busca del Dorado. El núcleo mayor de habitantes lo llamaban los naturales TABANOY, los españoles lo bautizaron como SAN PABLO DE SIBUNDOY, llevándolo a un territorio de impuestos y abusos. En el siglo XIX la independencia trajo para Sibundoy la liberación de impuestos, el régimen de Gobernador Indígena y Cabildo, ya existía escuela tradicional. En 1851 ya contaba con 837 habitantes. Sibundoy fue corregimiento Intendencial durante muchos años y erigido Municipio en 1982, aunque inició su vida administrativa en 1983.
